Det er meldt tilfeller av akutt betennelse i bukspyttkjertelen (pankreatitt) etter bruk av legemidler som inneholder karbimazol. Dessuten viser en gjennomgang av studier og bivirkningsmeldinger en sammenheng mellom bruk av karbimazol under svangerskap og medfødte misdannelser, spesielt ved bruk i første trimester samt ved høye doser.
Karbimazol finnes på markedet i Norge i produktet Neo-Mercazole. Disse risikoene gjelder imidlertid også for tiamazol, men tiamazol er bare godkjent til veterinærmedisinsk bruk i Norge.